Ny fototarazo maoderina dia namolavola fomba mahery vaika antsoina hoe fifantenana génomika izay mampiasa ny angona voarakitra ao amin'ny fototarazon'ny zavamaniry sy ny biby mba hanatsarana ny fiompiana.
Ny fifantenana génomika dia ahafahana maminavina ny mety ho fototarazon'ny olona iray amin'ny toetra irina, toy ny fanoherana ny aretina, ny vokatra, na ny kalitao, amin'ny fandinihana ny fahasamihafan'ny filaharan'ny ADN amin'ny olona tsirairay.
Ity angona fototarazo ity dia manampy amin'ny fandraisana fanapahan-kevitra tsara kokoa, manafaingana ny fizotry ny fifantenana, ary mamorona fandaharan'asa momba ny fiompiana izay mahomby sy mahavokatra kokoa.
Amin'ity sehatra mahaliana momba ny génétika ity, fianarana milina namorona zava-mahagaga sy manatsara ny sehatra. Andao handalina sy hianatra momba ny fianarana milina amin'ny fifantenana génomika.
Inona marina no atao hoe Genomic Selection?
Ny fifantenana génomika dia teknika ampiasaina amin'ny fiompiana biby sy zavamaniry mba haminavina ny zava-bitan'ny olona iray mifototra amin'ny firafitry ny fototarazony.
Tafiditra ao anatin'izany ny fijerena ny ADN-n'ny olona mba hahitana marika manokana mifandray amin'ny toetra irina.
Ny mpikaroka dia afaka mamaritra ny fototarazon'ny olona iray amin'ny endri-javatra toy ny fanoherana ny aretina, ny vokatra, na ny kalitao amin'ny alàlan'ny famakafakana ireo marika manerana ny génome manontolo.
Ny mpiompy dia afaka maminavina tsara kokoa ny zava-bitan'ny taranaka noho ny fifantenana genomika tsy mila fanombanana phenotypic mandany fotoana sy lafo.
Amin'ny alalan'ny fanomezana alalana ny mpiompy hisafidy olona manana fototarazo tsara indrindra ho an'ny fandaharan'asa fiompiana, ity fomba ity dia manampy amin'ny fanafainganana ny fizotry ny fiompiana amin'ny alàlan'ny fampivoarana mahomby kokoa sy mifantoka amin'ny toetra irina amin'ny isan'ny zavamaniry sy biby.
Fiompiana zavamaniry amin'ny alalan'ny fifantenana genomika
Ny fiompiana zavamaniry dia nandalo revolisiona noho ny fifantenana génomika, izay nanafaingana ny dingana sy nampitombo ny vokatra.
Fa mba hamahana ireo olana mianjady ateraky ny fiovan'ny toetr'andro dia ilaina ny fampandrosoana bebe kokoa.
Mba hamahana izany, ny mpikaroka dia mampiasa pangenomes sy fomba fianarana milina manara-penitra amin'ny fifantenana genomika.
Ny akora génomika iray manontolo amin'ny karazana iray, fantatra amin'ny anarana hoe pangenome, dia mamela ny fahatakarana lalina ny fiovaovan'ny fototarazo.
Afaka manokatra ny lalana ho amin'ny fanatsarana ny voly isika ary manamaivana ny voka-dratsin'ny fiovaovan'ny toetr'andro eo amin'ny fambolena amin'ny alalan'ny fijerena ohatra avy amin'ny fiompiana voly, ny fahatakarana ny teritery amin'ny fianarana milina, ary ny fanasongadinana ny fampanantenan'ireo teknika ireo.
Pangenomes amin'ny zava-maniry: manambara ny fahasamihafana génomika
Amin'ny fomba mahazatra, ny fivorian'ny genome reference tokana no tena ifantohan'ny fifantenana ny génomika, saingy lasa miely patrana ankehitriny ny pangenomes. Ny pangenomes amin'ny zavamaniry, fa tsy ny fitambaran'ny génomie tsirairay, dia maneho ny fototarazon'ny karazana na fianakaviana iray.
Ireo variana fototarazo manan-danja, anisan'izany ireo tsy tafiditra ao amin'ny fivorian'ny references, dia asehon'izy ireo. Ho an'ny voly maromaro dia noforonina ny pangenomes, manazava ny tantaran'ny fambolena sy fiompiana zavamaniry.
Ny fitambaran'izy ireo amin'ny fifantenana fototarazo dia mbola mahomby amin'ny ampahany ihany.
Ny mpiompy dia afaka mampiasa marika fototarazo isan-karazany kokoa, manatsara ny fahamarinan'ny faminaniana ary maka ny fifandraisana rehetra mety hitranga, amin'ny fampifangaroana ny pangenomes amin'ny fifantenana génomika.
Fifantenana génomika mifototra amin'ny fianarana milina
Ny fomba fifantenana genomika nentim-paharazana dia manana fahasarotana amin'ny fiatrehana ny fiantraikany tsy misy additive toy ny epistasis, ny fanontana genomika ary ny fifandraisana amin'ny genotype. Amin'ny fanaovana simulation ireo fiantraikany ireo, ny fomba fianarana milina dia manome valiny azo ampiharina.
Ny fanadihadiana vao haingana dia nampiasa fomba fianarana milina amin'ny fifantenana génomika, miaraka amin'ny valiny eo anelanelan'ny angona sy ny vokatra.
Algorithme fianarana milina dia afaka mitantana fanehoana angon-drakitra sarotra, toy ny phenotypes mifangaro sy ny fifandraisana misy eo amin'ny phenotypes na genotypes.
Ohatra, ny algorithm fianarana milina dia nampiasaina mba haminavina ny famokarana sy ny kalitaon'ny voankazo amin'ny voly polyploid toy ny frezy sy manga.
Na dia manana hery lehibe aza ireo rafitra ireo, ny fahatakarana ny fahaizan'ny fandikana azy sy ny fanitsiana ny hyperparameter dia tena ilaina amin'ny fampiharana mahomby.
Fomba samihafa amin'ny fianarana milina
Ao amin'ny fandalinana vinavina génomika, mitombo ny fampiasana teknika fianarana milina. Ireo teknika ireo dia azo sarahina amin'ny fomba fianarana manara-maso sy tsy manara-maso.
Ny fomba fianarana voaara-maso dia tena ilaina tokoa satria afaka mahita lamina ao izy ireo data misy marika ary manantena ny vokatra azo.
Na dia nandinika ny fahombiazan'ny fomba fianarana milina manokana aza ny fanadihadiana isan-karazany, dia tsy ampy ny fikarohana mampitaha fomba fiasa samihafa.
Zava-dehibe ny mahatakatra hoe iza amin'ireo fomba fiasa no mahomby kokoa ary mandanja ny tombony sy ny tsy fahampiana raha ampitahaina amin'ny fomba mahazatra.
Fomba Faminaniany Genomika Mampanantena
Modely mifangaro Linear
Ao amin'ny vinavinan'ny génomika, ny maodely mifangaro tsipika mahazatra dia voaporofo fa azo itokisana sy mahasoa. Mba hijerena ny fiovaovan'ny fototarazo eo amin'ny mponina, ireo modely ireo dia mampifandray ireo vokatra raikitra sy kisendrasendra.
Ireo algorithm ireo dia afaka maminavina tsara ny soatoavin'ny fiompiana génomika amin'ny alàlan'ny fiheverana ny fifandraisan'ny tsirairay.
Noho ny fahaizany maminavina amin'ny fifaninanana, ny fahombiazan'ny kajy ary ny fahatsoran'izy ireo, ny modely mifangaro linear dia ampiasaina betsaka amin'ny fiompiana zavamaniry sy biby. Mitaky mari-pamantarana fanitsiana kely kokoa noho ny fomba hafa izy ireo, ka mahatonga azy ireo ho mety amin'ny fifantenana génomika.
Regularized Regression
Ho an'ny vinavinan'ny génome, dia fitaovana mahomby ny fomba fihemorana ara-dalàna toy ny LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator) sy ny fihemorana.
Ireo teknika ireo dia manome fahafahana misafidy sy manara-penitra amin'ny alalan'ny fampidirana fe-potoana sazy amin'ny maodely fihemorana mahazatra.
Ireo fomba ireo dia mitantana angona avo lenta amin'ny fomba mahomby ary manatsara ny fahamarinan'ny faminaniana amin'ny alàlan'ny fampihenana ireo marika tsy dia misy dikany mankany amin'ny zero.
Ny teknika famerenana ara-dalàna dia safidy manintona amin'ny fifantenana génomika amin'ny fandalinana ny fiompiana zavamaniry sy biby satria mampifanaraka ny fahatsorana sy ny fahombiazany.
Ala kisendrasendra
Ny teknika fianarana ensemble antsoina hoe ala kisendrasendra dia manao faminaniana amin'ny fampiasana hazo fanapahan-kevitra. Ny ala kisendrasendra dia azo ampiasaina hanombanana ny angon-drakitra momba ny génomika avo lenta amin'ny tontolon'ny faminaniana momba ny génomika.
Amin'ny alalan'ity fomba ity, hazo fanapahan-kevitra marobe no aorina, samy voaofana amin'ny marika maromaro maromaro, ary ny faminaniany dia atambatra mba hamokatra vinavina tokana.
Ny ala kisendrasendra dia fitaovana ilaina amin'ny fifantenana ny fototarazo satria izy ireo dia afaka mamantatra ny fifaneraserana be pitsiny sy ny fifamatorana tsy misy tsipika eo amin'ny toetra sy ny marika.
Ny ala kisendrasendra ihany koa dia mahazaka ny tsy hita maso ary afaka mametraka angon-drakitra tsy hita, izay mampitombo ny sandan'izy ireo amin'ny vinavinan'ny génomika.
ANNs (tambajotra neural artificial)
artifisialy ny tambajotra vaovao, indraindray antsoina hoe ANNs na tambajotra neural, dia maodely kajy izay misintona aingam-panahy avy amin'ny rafitra neural ao amin'ny atidohan'olombelona.
Noho ny fahafahan'izy ireo hamantatra ireo lamina saro-pady sy fifandraisana amin'ny angon-drakitra, dia nanjary mahazatra ny ANN amin'ny vinavinan'ny fototarazo.
Ny ANN dia afaka mirakitra fifandraisana tsy an-tariby eo amin'ny marika sy ny toetra noho ny maritrano misy sosona maromaro sy ny node mifamatotra (neuron). Mila fiofanana feno amin'ny fampiasana angon-drakitra midadasika sy fanitsiana hyperparameter henjana ireo tambajotra ireo.
Amin'ny alalan'ny fanehoana rohy fototarazo saro-pady sy ny famantarana ny lamina miafina ao amin'ny angon-drakitra génomika, ny ANN dia afaka mampitombo ny fahamarinan'ny faminaniana génomika.
Toetra kendrena sy maha-zava-dehibe ny angona
Ny fanadihadiana dia mampiseho fa ny angon-drakitra manokana sy ny toetra kendrena tombanana dia misy fiantraikany amin'ny fahombiazan'ny faminaniana sy ny vidin'ny kajy amin'ny fomba fianarana milina.
Araka ny azo tsikaritra, ny fampitomboana ny fahasarotana amin'ny fomba fanao mahazatra mahazatra dia mety hiteraka fandaniana informatika lehibe nefa tsy voatery hanatsara ny faminaniany.
Fampiasam-bola mahomby amin'ny kajy
Noho ny fiankinan-doha amin'ny angon-drakitra kendrena sy ny toetra ho an'ny fampandehanana vinavina sy ny enta-mavesatry ny kajy, dia zava-dehibe ny fampiasam-bola amin'ny fanatsarana ny fahombiazan'ny kajy ny algorithm fianarana milina sy ny loharanon-karena.
Izany dia hanampy amin'ny fanatsarana ny fahitsiana sy ny fahombiazan'ny fifantenana génomika.
Famaranana - Inona no Hataon'ny Hoavy?
Ny fianarana milina amin'ny fifantenana génomika dia toa manana hoavy mamirapiratra. Ny teknika fianarana amin'ny milina dia mety hanova tanteraka ny vinavinan'ny fototarazo rehefa mivoatra ny teknolojia ary lasa azo ampiasaina betsaka kokoa ny loharanon-tserasera.
Ireo fomba ireo dia mamela ny fikarakarana angon-drakitra génomika avo lenta, ny fahitana ireo lamina saro-takarina, ary ny fampitomboana ny fahamarinan'ny faminaniana.
Amin'ny alàlan'ny fanamorana ny fifantenana haingana sy marina kokoa ny olona manana endri-javatra irina, ny fitambaran'ny algorithm fianarana milina miaraka amin'ny fifantenana génomika dia mitazona ny fahafahana manatsara ny programa fiompiana.
Mba hanatsarana ireo teknika ireo, hiatrehana ny olana momba ny kajy, ary hanadihady ny fampiharana azy ireo amin'ny karazana zavamaniry sy biby samihafa, dia ilaina ny fandalinana bebe kokoa.
Manantena izahay fa ho lasa manan-danja hatrany ny fianarana milina amin'ny fifantenana génomika rehefa mivoatra ny teknolojia, manafaingana ny tahan'ny fivoaran'ny fototarazo ary manampy ny sehatry ny fambolena.
Leave a Reply